Frederik Werth studierte an der Friedrich-Wilhelm-Universität Bonn Philosophie und Musikwissenschaften/Sound Studies, bevor er als Regieassistent am Theater Bonn engagiert wurde. Hier kuratierte er gemeinsam mit weiteren Assistenten des Theater Bonns das offene Format »Late Night – Klappe die...«, zudem entstanden erste eigene Arbeiten.
Neben der Regie arbeitet Frederik Werth auch im Sound- und Videobereich u. a. mit Luise Voigt, Reinhild Hoffmann, Sebastian Kreyer und dem Theater Blackbox. Mit Alois Reinhardt bildet er gemeinsam die Performancegruppe AAWKIISO, mit Fee Zweipfennig das Kollektiv PHASE IV.